对大肠杆菌(E.coli)的首次大规模遗传学研究表明，耐药超级细菌并不总是与其他菌株竞争，大肠杆菌来自英国血液感染患者。 Wellcome Trust Sanger研究所及其合作者的研究表明，新型大肠杆菌经常出现，但与其他一些感染不同，耐药菌株并不是感染的主要原因。
研究人员今天在Genome Research发表了一项研究，检测了十多年来从血液感染患者中分离的大量大肠杆菌，其中一些对许多抗生素具有抗性，而另外一些则不具有抗性。研究人员发现，感染可以由超过200种大肠杆菌引起。随着时间的推移，包括多药耐药大肠杆菌在内的新菌株被发现在收集物中，但是这些菌株很快与菌群中的其他菌株达成了平衡，而不是随着时间的推移而增加。
大肠杆菌是人类消化道天然携带的非常常见的细菌，但也是血液感染的主要原因。2014年英国有35，676例，通常来自于尿路或胃肠道感染的传播。
研究者已经广泛研究了某些大肠杆菌菌株，如耐多种抗生素的超级菌株ST131。但是这项研究采用了不同的方法 - 而不仅仅着重于抗生素耐药菌株，这项研究进一步收集了1509种大肠杆菌，其大部分来自英国各地，时间超过11年。研究人员利用全基因组测序，发现了228种不同的大肠杆菌菌株。
该研究记录到ST131于2002年首次出现在英国。在短时间内，ST131分离株的数量与其他类型的细菌达到了平衡。大约在同一时间，另一种类型(ST69，不是多重耐药菌株)也已出现，并且在总体菌群中再次迅速达到平衡。
Wellcome Trust Sanger研究所和伦敦卫生与热带医学学院的Sharon Peacock教授说：这些研究结果表明，新型大肠杆菌的出现并不少见，并且必须跟其他类型的成功竞争成为人类感染的主要原因，这种平衡的原因可能与所有细菌不断相互竞争取得一席之地(如肠道)有关。
该研究发现五种菌株占比超过分离株的一半。超级细菌ST131是第二常见的菌株，抗生素敏感菌株ST73是最常见的菌株。研究人员发现，不同的菌株携带不同的基因组，可能成为其成功的基础。其中许多是使其能够在肠道或尿道中生存的毒力基因，但有些是使它们与其他细菌更好竞争的基因。
Sanger研究所的Julian Parkhill博士说：我们的研究表明，大肠杆菌不同菌株的成功有许多原因，其中包括细菌之间的竞争，以及与人宿主的相互作用和抗生素耐药性。这表明导致血液感染的大肠杆菌的最终来源是广泛社区中多种细菌群体。
Wellcome耐药感染主管Tim Jinks表示：大肠杆菌是血液感染的主要原因，这项研究有助于说明多药耐药菌株的获取和传播具有难以置信的复杂性。寻找新的有效治疗多药抗性菌株仍然是重中之重。
原始出处：
Kallonen,T. et al.Systematic longitudinal survey of invasive Escherichia coli in England demonstrates a stable population structure only transiently disturbed by the emergence of ST131.Genome Research. Aug 2017.
