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楼主  发表于: 2011-05-12 00:09

 第一章 生物芯片原理(1)

管理提醒: 本帖被 silverks 执行加亮操作(2011-05-27)
生物芯片技术

  20世纪90年代初开始实施的人类基因组计划(Human genome project,HGP)取得
了人们当初意料不到的巨大进展。目前已经测定了十多种微生物以及高等动植物的全基
因组序列,海量的基因序列数据正在以前所未有的速度膨胀。一个现实的科学问题摆到
了人们面前:如何研究如此众多基因在生命过程中所担负的功能?如何有效利用如此海
量的基因信息揭示人类生老病死的一般规律,并为人类最终战胜各种病魔提供有效武器
?于是,一项类似于计算机芯片技术的新兴生物高技术———,随着人类基因组研究的
进展应运而生了。生物芯片的种类生物芯片是近10年在生命科学领域中迅速发展起来的
一项高新技术。它主要是指通过微加工和微电子技术在固体芯片表面构建微型生物化学
分析系统,以实现对生命机体的组织、细胞、蛋白质、核酸、糖类以及其他生物组分进
行准确、快速、大信息量的检测。目前常见的生物芯片分为三大类:即基因芯片(
Genechip,DNAchip,DNAmicroarray)、蛋白芯片(Proteinchip)、芯片实验室(
Lab-on-a-chip)等。

  生物芯片主要特点是高通量、微型化和自动化。生物芯片上高度集成的成千上万密
集排列的分子微阵列,能够在很短时间内分析大量的生物分子,使人们能够快速准确地
获取样品中的生物信息,检测效率是传统检测手段的成百上千倍。生物芯片将是继大规
模集成电路之后的又一次具有深远意义的科学技术革命。基因芯片是生物芯片技术中发
展最成熟和最先实现商品化的产品。基因芯片是基于核酸探针互补杂交技术原理而研制
的。所谓核酸探针只是一段人工合成的碱基序列,在探针上连接上一些可检测的物质,
根据碱基互补的原理,利用基因探针到基因混合物中识别特定基因。基因芯片,又称
DNA芯片,DNA微阵列(DNAmicroar ray),和我们日常所说的计算机芯片非常相似,只
不过高度集成的不是半导体管,而是成千上万的网格状密集排列的基因探针,通过已知
碱基顺序的DN段,来结合碱基互补序列的单链DNA,从而确定相应的序列,通过这种
方式来识别异常基因或其产物等。目前,比较成熟的产品有检测基因突变的基因芯片和
检测细胞基因表达水平的基因表达谱芯片。基因芯片技术主要包括四个基本技术环节:
芯片微阵列制备、样品制备、生物分子反应和信号的检测及分析。

  目前制备芯片主要采用表面化学的方法或组合化学的方法来处理固相基质如玻璃片
或硅片,然后使DN段或蛋白质分子按特定顺序排列在片基上。目前已有将近40万种
不同的DNA分子放在1平方厘米的高密度基因芯片,并且正在制备包含上百万个DNA探针
的人类基因芯片。生物样品的制备和处理是基因芯片技术的第二个重要环节。生物样品
往往是非常复杂的生物分子混合体,除少数特殊样品外,一般不能直接与芯片进行反应
。要将样品进行特定的生物处理,获取其中的蛋白质或DNA、RNA等信息分子并加以标记
,以提高检测的灵敏度。第三步是生物分子与芯片进行反应。芯片上的生物分子之间的
反应是芯片检测的关键一步。通过选择合适的反应条件使生物分子间反应处于最佳状况
中,减少生物分子之间的错配比率,从而获取最能反映生物本质的信号。基因芯片技术
的最后一步就是芯片信号检测和分析。目前最常用的芯片信号检测方法是将芯片置入芯
片扫描仪中,通过采集各反应点的荧光强弱和荧光位置,经相关软件分析图像,即可以
获得有关生物信息。

  蛋白芯片与基因芯片的原理相似。不同之处有,一是芯片上固定的分子是蛋白质如
抗原或抗体等。其二,检测的原理是依据蛋白分子、蛋白与核酸、蛋白与其它分子的相
互作用。蛋白芯片技术出现得较晚,尚处于发展时期,最近也取得了重大进展。例如,
最近一期国际著名科学(Science)杂志报道了酵母蛋白质组芯片(proteomechip)
。这是目前为止第一个包含一种生物全部蛋白质分子的蛋白质芯片。相信,不久将会有
包含更高等生物甚至人类蛋白质组的蛋白质芯片研制成功,并应用于生物医学基础研究
和疾病诊断。芯片实验室是生物芯片技术发展的最终目标。它将样品制备、生化反应以
及检测分析的整个过程集约化形成微型分析系统。现在已有由加热器、微泵、微阀、微
流量控制器、微电极、电子化学和电子发光探测器等组成的芯片实验室问世,并出现了
将生化反应、样品制备、检测和分析等部分集成的生物芯片。

  例如可以将样品制备和PCR扩增反应同时在一块小小的芯片上完成。再如GeneLogic
公司设计制造的生物芯片可以从待检样品中分离出DNA或 RNA,并对其进行荧光标记,
然后当样品流过固定于栅栏状微通道内的寡核苷酸探针时便可捕获与之互补的靶核酸序
列。应用自主开发的检测设备即可实现对杂交结果的检测与分析。这种芯片由于寡核苷
酸探针具有较大的吸附表面积,可以很灵敏地检测到稀有基因的变化。同时,由于该芯
片设计的微通道具有浓缩和富集作用,所以可以加速杂交反应,缩短测试时间,从而降
低了测试成本。国内外研究现状生物芯片技术的飞速发展引起了世界各国的广泛**************和
重视。1998年6月 29日美国宣布正式启动生物芯片计划,美国国立卫生部、能源部、商
业部、司法部、国防部、中央情报局等均参与了此项目。

  同时斯坦福大学、麻省理工学院及部分国家实验室也参与了该项目的研究和开发。
世界各国也纷纷加大投入,英国剑桥大学、欧亚公司正在从事该领域的研究。世界大型
制药公司尤其对基因芯片技术用于基因多态性、疾病相关性、基因药物开发和合成或天
然药物筛选等领域感兴趣,都已建立了或正在建立自己的芯片设备和技术。以生物芯片
为核心的相关产业正在全球崛起,目前美国已有10多家生物芯片公司股票上市,平均每
年股票上涨75%。专家统计:全球目前生物芯片工业产值为10亿美元左右,预计今后5
年之内,生物芯片的市场销售可达到200亿美元以上。

  美国《财富》杂志刊文指出,微处理器使我们的经济发生了根本变化,给人类带来
了巨大的财富,改变了我们的生活方式。然而,生物芯片给人类带来的影响可能更大。
在20世纪科技史上有两件事影响深远,一是微电子芯片,它是计算机和许多家电的心脏
,它改变了我们的经济和文化生活,并已进入每一个家庭;另一件事就是生物芯片,它
将改变生命科学的研究方式,革新医学诊断和治疗,极大地提高人口素质和健康水平。

  生物芯片作为基因工业的一部分,可广泛用于医学临床诊断、药物开发、环境监测
等领域,有着广阔的市场前景,对人类生活与健康将产生多方面深远影响。鉴于生物芯
片技术具有巨大理论意义和实际价值,也为了我国生物芯片技术不再重蹈计算机芯片的
覆辙,我国政府、科技界和商业界几乎同时意识到生物芯片技术的重大战略意义和蕴藏
的无限商机,开展了生物芯片技术研发。其中最具代表性的事件就是2000年初由国内从
事生物芯片技术研究的多家单位进行强强联合成立了国家生物芯片技术中心。中国工程
院2000年1月6日在京举办首次工程科技论坛,专题定为“生物芯片技术”,与会科学家
呼吁:以生物芯片技术为核心的各相关产业正在全球崛起,世界工业发达国家已开始有
计划、大投入、争先恐后地对该领域知识产权进行保护。我国应迅速制定适合中国国情
的对策,以避免出现像计算机产业那样因没有自己的芯片专利和技术而受制于人的被动
局面。目前国内已有多家科研单位开始从事这方面的研究。例如,清华大学、中国科学
院、军事医学科学院等单位在国内率先开展了生物芯片技术研究,建立了生物芯片技术
体系,并已在生物芯片技术和产品开发方面取得了较大突破。可以相信不久将有我国自
主生产的生物芯片产品投放市场。

  生物芯片的应用生物芯片应用前景十分广阔。如可以应用于寻找新基因、DNA测序
、疾病诊断、药物筛选、毒理基因组学、农作物优育和优选、环境检测和防治、食品卫
生监督以及司法鉴定等等。使用基因芯片分析人类基因组,可找出癌症、糖尿病由遗传
基因缺陷引起疾病的致病的遗传基因。生物医学研究人员可以在数秒钟内鉴定出导致癌
症的突变基因。借助一小滴测试液,医生们能预测药物对病人的功效和是否有毒副作用
。利用基因芯片分析遗传基因,未来可以使糖尿病的确诊率达到50%以上。可以想象,
未来人们在体检时,由搭载基因芯片的诊断机器人对受检者取血,转瞬间体检结果便可
以显示在计算机屏幕上。利用基因诊断,医疗将从目前千篇一律的“大众医疗”的时代
,过渡到依据个人遗传背景而异的“个体化医疗”的时代。生物芯片在疾病检测诊断方
面具有独特的优势,它可以在一张芯片上同时对多个病人进行多种疾病的检测。仅用极
小量的样品,在极短时间内,向医务人员提供大量的疾病诊断信息,这些信息有助于医
生在短时间内找到正确的治疗措施。例如对肿瘤、糖尿病、传染性疾病等常见病和多发
病的临床检验及健康人群检查,均可以应用生物芯片技术。今后人们可以拥有个人化验
室,无论在地球任何地方,随时可以对自己的健康状况进行监测。在药物筛选方面,目
前国外几乎所有的主要制药公司都不同程度地采用了生物芯片技术来寻找药物靶标,查
检药物的毒性或副作用。用芯片技术进行大规模的药物筛选可以省略大量的动物试验,
缩短药物筛选所用时间,从而带动创新药物的研究和开发。基因芯片在环保方面的应用
表现在,可高效地探测到由微生物或有机物引起的污染,还能帮助研究人员找到并合成
具有解毒和消化污染物功能的天然酶基因。这种对环境友好的基因一旦被发现,研究人
员将把它们转入普通的细菌中,然后用这种转基因细菌清理被污染的河流或土壤。另外
生物芯片在农业、食品监督、司法鉴定等方面都将作出重大贡献。生物芯片技术的深入
研究和广泛应用,将对21世纪人类生活和健康产生极其深远的影响。作者简介王升启博
士,军事医学科学院放射医学研究所研究员,国家生物芯片技术中心副主任,军队生物
芯片技术重点实验室主任。总后科技银星。

  主要研究方向有:基因芯片技术研究和开发;反义技术和反义药物;中药基因组学
和化学组学研究等。近年来主持国家863项目、国家973项目、国家自然科学基金重点项
目和面上项目,以及军队和北京市重点项目等多项课题研究。在国内外刊物发表论文
100多篇,获得和申请国家发明专利10余项,出版专著2 部,获得军队和省级科学技术
进步奖3项。斌博士,军事医学科学院放射医学研究所副研究员。1999年7月于军事
医学科学院获生物化学与分子生物学博士学位后,即在放射医学研究所生物技术实验室
和军队生物芯片技术重点实验室工作。主要研究方向有:病毒基因芯片技术;应用基因
芯片技术研究病毒与宿主相互作用分子机理以及抗病毒药物基础研究等;近年来参与和
主持国家863项目、国家973项目、国家自然科学基金重点项目等多项课题研究。在国内
外刊物发表论文 20多篇,获得和申请国家发明专利2项,获得军队和省级科学技术进步
奖2项。


  资料

  ●生物芯片是指通过微加工和微电子技术在固体芯片表面构建微型生物化学分析系统
  ●和计算机芯片非常相似,只不过高度集成的不是半导体管,而是成千上万的网格
状密集排列的基因探针
  ●未来人们在体检时,由搭载基因芯片的诊断机器人对受检者取血,转瞬间体检结
果便可以显示在计算机屏幕上
  ●全球目前生物芯片工业产值为10亿美元左右,预计今后5年之内,生物芯片的市
场销售可达到200亿美元以上生物芯片面面观

摘自:《生物通》全军生物芯片技术重点实验室 斌 王升启

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