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2018-11-23 09:40 |
瑞典卡罗林斯卡研究所的研究人员本周三在《Genome Medicine》上发表了强有力的新数据，表明液体活检有能力检测晚期前列腺癌患者血液中的一系列肿瘤相关基因组改变。
研究人员表示，与其他类型的癌症相比，尽管前列腺癌的生物标志物指导治疗仍处于起步阶段，但人们对预测性的生物标志物和非侵入性的方法抱有浓厚的兴趣。然而，对患者游离DNA的全面分析仍然受到限制。
在这项研究中，研究团队利用靶向测序和全基因组测序，对217名转移性前列腺癌患者的364个血液样本中的游离DNA进行测序。他们总共在86％的样本中检测到循环肿瘤DNA。他们还能测定循环肿瘤DNA水平的差异，这与患者的治疗次数相对应。
研究人员发现，循环肿瘤DNA的遗传图谱与转移组织的图谱密切相关。他们可检测到各种不同的遗传改变，包括单核苷酸变异、拷贝数改变和结构变化。大约18%的患者的DNA修复基因表现出频繁的改变，这也是临床生物标志物研究的重点。
对于肿瘤负荷高的患者，他们发现关键肿瘤抑制因子的失活是双等位基因，而不是单等位基因，只有一个例外。同时，他们还计算了一部分样本的微卫星不稳定性（MSI）水平，这一指标逐渐应用于临床，以确定适合免疫治疗的患者。根据循环DNA的分析，大约3.8%的队列人群有着高的微卫星不稳定性。
研究人员还发现，前列腺癌患者的游离DNA浓度与循环肿瘤DNA的比例密切相关，这有望成为监控疾病的一种方式。这些证据表明，对游离DNA整体浓度的测定，有望替代血液中肿瘤组分的测定。
与其他研究一样，研究人员也检测到患者白细胞中的遗传改变和克隆扩增，他们认为有可能是假阳性的。相当多的患者存在这种现象，他们称之为意义不明的克隆性造血（CHIP）。作者写道，31名患者存在40个假阳性变异。
检测开发商已经将CHIP列为所有液体活检测序的潜在干扰因素。作者认为，这些研究结果支持了一项结论，即血液检测需要配对的正常样本测序，才能提供更准确的结果，并避免假阳性。
目前，研究人员开始对前列腺癌患者进行一项前瞻性试验，利用循环肿瘤DNA分析来鉴定体细胞改变。“我们的目标是确定基于生物标志物的疗法选择是否能延长无进展生存期，并评估生物标志物的预测能力，”他们写道。
原文检索：
Cell-free DNA profiling of metastatic prostate cancer reveals microsatellite instability, structural rearrangements and clonal hematopoiesis
Genome Medicine 2018 10: 85
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